Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP3P50461 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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