Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATMP50440 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATMP50440 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATMP50440 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATMP50440 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATMP50440 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATMP50440 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATMP50440 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATMP50440 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms