Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF6P49848 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF6P49848 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF6P49848 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF6P49848 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF6P49848 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF6P49848 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF6P49848 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF6P49848 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF6P49848 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms