Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms