Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HARS2P49590 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HARS2P49590 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HARS2P49590 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms