Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX1P48742 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX1P48742 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX1P48742 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX1P48742 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX1P48742 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms