Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNC1P48547 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms