Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSSP48449 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSSP48449 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSSP48449 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSSP48449 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSSP48449 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSSP48449 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LSSP48449 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms