Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms