Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP5P45974 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP5P45974 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP5P45974 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP5P45974 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP5P45974 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP5P45974 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP5P45974 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP5P45974 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP5P45974 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP5P45974 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP5P45974 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP5P45974 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP5P45974 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP5P45974 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms