Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A2P43004 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A2P43004 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms