Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARSP41250 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GARSP41250 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARSP41250 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARSP41250 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARSP41250 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARSP41250 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARSP41250 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms