Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH1P40692 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH1P40692 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH1P40692 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH1P40692 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH1P40692 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH1P40692 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH1P40692 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH1P40692 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH1P40692 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH1P40692 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH1P40692 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLH1P40692 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms