Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL4AP40617 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms