Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms