Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFBP38117 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFBP38117 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFBP38117 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFBP38117 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFBP38117 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFBP38117 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFBP38117 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms