Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF1P36956 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms