Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYH11P35749 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYH11P35749 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH11P35749 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH11P35749 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH11P35749 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH11P35749 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH11P35749 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH11P35749 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms