Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN2P35609 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms