Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF4P34130 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF4P34130 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF4P34130 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF4P34130 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms