Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSP1P33241 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSP1P33241 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSP1P33241 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSP1P33241 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSP1P33241 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSP1P33241 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSP1P33241 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms