Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	SPS4	YOR313C	1017 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	PRP3	YDR473C	1410 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	VPS27	YNR006W	1869 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	QRI7	YDL104C	1224 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	ECM16	YMR128W	3804 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	MOH1	YBL049W	417 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	SIL1	YOL031C	1266 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	DDP1	YOR163W	567 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VMA11	P32842	GCN5	YGR252W	1320 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	HMS1	YOR032C	1305 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	CLB5	YPR120C	1308 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RSF2	YJR127C	4143 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YAK1	YJL141C	2424 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RAD2	YGR258C	3096 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RNR1	YER070W	2667 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RSC1	YGR056W	2787 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	OKP1	YGR179C	1221 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SPO16	YHR153C	597 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YJL028W	YJL028W	336 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YUH1	YJR099W	711 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	URC2	YDR520C	2319 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SQS1	YNL224C	2304 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	CIT1	YNR001C	1440 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	NRP1	YDL167C	2160 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RPN2	YIL075C	2838 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	AKR1	YDR264C	2295 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RAD7	YJR052W	1698 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	GAT2	YMR136W	1683 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YOL019W	YOL019W	1656 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MTR4	YJL050W	3222 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	NAT1	YDL040C	2565 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PWP2	YCR057C	2772 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	FAD1	YDL045C	921 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ERV29	YGR284C	933 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ECM4	YKR076W	1113 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SSO2	YMR183C	888 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	TDA3	YHR009C	1572 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PFK26	YIL107C	2484 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YDL032W	YDL032W	312 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RPC11	YDR045C	333 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PAU10	YDR542W	363 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PAU11	YGL261C	363 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PEX21	YGR239C	867 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PAU13	YHL046C	363 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YAL004W	YAL004W	648 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PAU4	YLR461W	363 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RPL19B	YBL027W	570 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	TMA16	YOR252W	537 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	BMT2	YBR141C	1014 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ALG1	YBR110W	1350 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SPA2	YLL021W	4401 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	TSR1	YDL060W	2367 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	FUN12	YAL035W	3009 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	PGS1	YCL004W	1566 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MGA1	YGR249W	1371 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	NEM1	YHR004C	1341 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	OPI6	YDL096C	327 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MSS2	YDL107W	1056 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YGL074C	YGL074C	327 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YGR219W	YGR219W	342 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YIR040C	YIR040C	333 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ANB1	YJR047C	474 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	VPS28	YPL065W	729 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YPL168W	YPL168W	1293 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	FAS1	YKL182W	6156 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	NUP85	YJR042W	2235 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	OSH3	YHR073W	2991 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SMI1	YGR229C	1518 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SHQ1	YIL104C	1524 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YDR149C	YDR149C	708 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SEC53	YFL045C	765 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YGL101W	YGL101W	648 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YGL214W	YGL214W	486 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	TRI1	YMR233W	681 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	TIR2	YOR010C	756 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RPS7A	YOR096W	573 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YNR063W	YNR063W	1824 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	EPO1	YMR124W	2832 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	SER3	YER081W	1410 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ERG9	YHR190W	1335 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MCM21	YDR318W	1107 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	HAT2	YEL056W	1206 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ERJ5	YFR041C	888 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	USE1	YGL098W	738 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	BET1	YIL004C	429 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ARC15	YIL062C	465 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MTR2	YKL186C	555 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RIM11	YMR139W	1113 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YOR314W	YOR314W	330 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	YPL071C	YPL071C	471 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	MCM16	YPR046W	546 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	RIB5	YBR256C	717 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ETP1	YHL010C	1758 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	LCB5	YLR260W	2064 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VMA11	P32842	ARO9	YHR137W	1542 nt		2.78	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	POL31	YJR006W	1464 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	PRS5	YOL061W	1491 nt		2.77	□□□□□ -1.97

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