Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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