Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms