Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms