Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms