Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK3P27448 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK3P27448 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK3P27448 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARK3P27448 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARK3P27448 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARK3P27448 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK3P27448 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK3P27448 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms