Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN3P26045 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN3P26045 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN3P26045 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms