Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO1P25800 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO1P25800 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMO1P25800 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO1P25800 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms