Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2AP24928 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms