Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCHP24723 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms