Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms