Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PRKACBP22694 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKACBP22694 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1168.7 ms