Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms