Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDHBP21953 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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