Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASTP20810 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASTP20810 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASTP20810 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASTP20810 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASTP20810 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASTP20810 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASTP20810 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASTP20810 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASTP20810 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASTP20810 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms