Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTF3P20783 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NTF3P20783 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms