Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFE3P19532 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFE3P19532 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFE3P19532 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFE3P19532 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFE3P19532 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFE3P19532 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFE3P19532 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFE3P19532 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFE3P19532 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms