Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD58P19256 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD58P19256 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD58P19256 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD58P19256 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD58P19256 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CD58P19256 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD58P19256 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD58P19256 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms