Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms