Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms