Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPBP14678 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms