Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB3P14651 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms