Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT13P13646 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT13P13646 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT13P13646 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT13P13646 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT13P13646 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT13P13646 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT13P13646 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT13P13646 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT13P13646 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT13P13646 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms