Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM1P11229 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms