Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAMP11215 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms