Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD3P0DMS9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms