Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2BP0DMP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms