Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTAP09496 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTAP09496 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTAP09496 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTAP09496 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTAP09496 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTAP09496 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms