Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPAP09012 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPAP09012 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms